Prodi Kedokteran di UNIDA Gontor mempersiapkan mahasiswa untuk menjadi dokter yang kompeten, berintegritas, dan berakhlak mulia. Kurikulum kedokteran berfokus pada ilmu kedokteran dasar, ilmu klinis, serta kemampuan praktis yang sesuai dengan standar nasional dan internasional. Mahasiswa akan mempelajari anatomi, fisiologi, farmakologi, hingga keterampilan klinis yang dibutuhkan dalam praktik kedokteran sehari-hari. Program ini juga menekankan pendekatan Islami dalam pelayanan kesehatan, sehingga lulusan mampu memberikan pelayanan medis yang profesional dan beretika.