FK UNIDA Gontor dalam mendukung proses pembelajaran telah menjalin kerja sama dengan sejumlah rumah sakit pendidikan sebagai upaya mendukung pembelajaran mahasiswa kedokteran. Rumah sakit ini dipilih berdasarkan kelayakan akademik untuk menyediakan tempat pelatihan klinis yang berkualitas, di mana mahasiswa dapat berlatih keterampilan medis secara langsung. Melalui kerja sama ini, rumah sakit pendidikan berfungsi sebagai pusat pelayanan kesehatan, pelatihan klinis, dan penelitian yang terintegrasi dengan fakultas kedokteran, memungkinkan mahasiswa untuk menangani pasien di bawah pengawasan dokter berpengalaman.

Selain memberikan pengalaman klinis yang komprehensif—mulai dari pemeriksaan fisik, diagnosis, perencanaan terapi, hingga pelaksanaan prosedur medis sesuai standar—rumah sakit pendidikan juga mengembangkan kemampuan mahasiswa dalam komunikasi profesional, pengambilan keputusan klinis, serta pemahaman etika kedokteran.

Rumah sakit pendidikan ini juga berperan penting dalam riset dan pengembangan ilmu kedokteran, di mana fakultas kedokteran dan tenaga medis bekerja sama untuk menciptakan inovasi dalam diagnostik, perawatan, dan teknologi kesehatan. Sinergi antara FK UNIDA Gontor dan rumah sakit pendidikan diharapkan mampu meningkatkan kualitas pendidikan, layanan kesehatan, dan penelitian, sehingga menghasilkan tenaga medis yang kompeten dan mendukung kemajuan kesehatan masyarakat.